Cytoscape项目致力于为用户提供一个开源的网络显示和分析软件。软件的核心部分提供了网络显示、布局、查询等方面的基本功能。软件的核心部分可以通过插件架构进行扩展。Cytoscape的核心是网络图，其中的节点是基因、蛋白质或分子，其中的连接则是这些生物结构之间的相互作用。
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