Spark 入门(Python、Scala 版)
本文中,我们将首先讨论如何在本地机器上利用Spark进行简单分析。然后,将在入门级水平探索Spark,了解Spark是什么以及它如何工作(希望可以激发更多探索)。最后两节将开始通过命令行与Spark进行交互,然后演示如何用Python写Spark应用,并作为Spark作业提交到集群上。同时也会提供相应的 Scala 版本。
1、设置Spark环境
在本机设置和运行Spark非常简单。你只需要下载一个预构建的包,只要你安装了Java 6+和Python 2.6+,就可以在Windows、Mac OS X和Linux上运行Spark。确保java程序在PATH环境变量中,或者设置了JAVA_HOME环境变量。类似的,python也要在PATH中。
假设你已经安装了Java和Python,以及 Spark,如果没有请参照之前的教程:
《Spark 伪分布式 & 全分布式 安装指南》:http://my.oschina.net/leejun2005/blog/394928
注意:如果要用到下文的 pyspark,则需要设置 python 相关的 spark 包路径:
vi .bashrc export PYTHONPATH=$SPARK_HOME/python/:$SPARK_HOME/python/lib/py4j-0.8.2.1-src.zip:$PYTHONPATH
否则会报错: ImportError: No module named pyspark 或者 ImportError: No module named py4j.java_gateway
source这些配置(或者重启终端)之后,你就可以在本地运行一个pyspark解释器。执行pyspark命令,你会看到以下结果:
~$ pyspark Python 2.7.8 (default, Dec 2 2014, 12:45:58) [GCC 4.2.1 Compatible Apple LLVM 6.0 (clang-600.0.54)] on darwin Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information. Spark assembly has been built with Hive, including Datanucleus jars on classpath Using Sparks default log4j profile: org/apache/spark/log4j-defaults.properties [… snip …] Welcome to ____ __ / __/__ ___ _____/ /__ _\ \/ _ \/ _ `/ __/ `_/ /__ / .__/\_,_/_/ /_/\_\ version 1.2.0 /_/ Using Python version 2.7.8 (default, Dec 2 2014 12:45:58) SparkContext available as sc. >>>
现在Spark已经安装完毕,可以在本机以”单机模式“使用。你可以在本机开发应用并提交Spark作业,这些作业将以多进程/多线程模式运行的,或者,配置该机器作为一个集群的客户端(不推荐这样做,因为在Spark作业中,驱动程序(driver)是个很重要的角色,并且应该与集群的其他部分处于相同网络)。
2、简化 Spark 终端输出
Spark(和PySpark)的执行可以特别详细,很多INFO日志消息都会打印到屏幕。开发过程中,这些非常恼人,因为可能丢失Python栈跟踪或者print的输出。为了减少Spark输出 – 你可以设置$SPARK_HOME/conf下的log4j。首先,拷贝一份$SPARK_HOME/conf/log4j.properties.template文件,去掉“.template”扩展名。
编辑新文件,用WARN替换代码中出现的INFO。你的log4j.properties文件类似:
~$ pyspark Python 2.7.8 (default, Dec 2 2014, 12:45:58) [GCC 4.2.1 Compatible Apple LLVM 6.0 (clang-600.0.54)] on darwin Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information. Spark assembly has been built with Hive, including Datanucleus jars on classpath Using Sparks default log4j profile: org/apache/spark/log4j-defaults.properties [… snip …] Welcome to ____ __ / __/__ ___ _____/ /__ _\ \/ _ \/ _ `/ __/ `_/ /__ / .__/\_,_/_/ /_/\_\ version 1.2.0 /_/ Using Python version 2.7.8 (default, Dec 2 2014 12:45:58) SparkContext available as sc. >>>
现在运行PySpark,输出消息将会更简略!
3、测试 Spark context
talk is cheap,show you the code. 咱们先来测试下 Spark 环境是否正常:
from pyspark import SparkContext from pyspark.streaming import StreamingContext sc = SparkContext("spark://110.9.17.187:8070", "NetworkWordCount") data = [1, 2, 3, 4, 5] distData = sc.parallelize(data) distData.reduce(lambda a, b: a + b)
如果你能得到一个数字 15,而且没有错误发生,那么你的context正确工作了!
4、Spark是什么?
既然设置好了Spark,现在我们讨论下Spark是什么。Spark是个通用的集群计算框架,通过将大量数据集计算任务分配到多台计算机上,提供高效内存计算。如果你熟悉Hadoop,那么你知道分布式计算框架要解决两个问题:如何分发数据和如何分发计算。Hadoop使用HDFS来解决分布式数据问题,MapReduce计算范式提供有效的分布式计算。类似的,Spark拥有多种语言的函数式编程API,提供了除map和reduce之外更多的运算符,这些操作是通过一个称作弹性分布式数据集(resilient distributed datasets, RDDs)的分布式数据框架进行的。
本质上,RDD是种编程抽象,代表可以跨机器进行分割的只读对象集合。RDD可以从一个继承结构(lineage)重建(因此可以容错),通过并行操作访问,可以读写HDFS或S3这样的分布式存储,更重要的是,可以缓存到worker节点的内存中进行立即重用。由于RDD可以被缓存在内存中,Spark对迭代应用特别有效,因为这些应用中,数据是在整个算法运算过程中都可以被重用。大多数机器学习和最优化算法都是迭代的,使得Spark对数据科学来说是个非常有效的工具。另外,由于Spark非常快,可以通过类似Python REPL的命令行提示符交互式访问。
Spark库本身包含很多应用元素,这些元素可以用到大部分大数据应用中,其中包括对大数据进行类似SQL查询的支持,机器学习和图算法,甚至对实时流数据的支持。
核心组件如下:
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Spark Core:包含Spark的基本功能;尤其是定义RDD的API、操作以及这两者上的动作。其他Spark的库都是构建在RDD和Spark Core之上的。
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Spark SQL:提供通过Apache Hive的SQL变体Hive查询语言(HiveQL)与Spark进行交互的API。每个数据库表被当做一个RDD,Spark SQL查询被转换为Spark操作。对熟悉Hive和HiveQL的人,Spark可以拿来就用。
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Spark Streaming:允许对实时数据流进行处理和控制。很多实时数据库(如Apache Store)可以处理实时数据。Spark Streaming允许程序能够像普通RDD一样处理实时数据。
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MLlib:一个常用机器学习算法库,算法被实现为对RDD的Spark操作。这个库包含可扩展的学习算法,比如分类、回归等需要对大量数据集进行迭代的操作。之前可选的大数据机器学习库Mahout,将会转到Spark,并在未来实现。
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GraphX:控制图、并行图操作和计算的一组算法和工具的集合。GraphX扩展了RDD API,包含控制图、创建子图、访问路径上所有顶点的操作。
由于这些组件满足了很多大数据需求,也满足了很多数据科学任务的算法和计算上的需要,Spark快速流行起来。不仅如此,Spark也提供了使用Scala、Java和Python编写的API;满足了不同团体的需求,允许更多数据科学家简便地采用Spark作为他们的大数据解决方案。
5、对Spark编程
编写Spark应用与之前实现在Hadoop上的其他数据流语言类似。代码写入一个惰性求值的驱动程序(driver program)中,通过一个动作(action),驱动代码被分发到集群上,由各个RDD分区上的worker来执行。然后结果会被发送回驱动程序进行聚合或编译。本质上,驱动程序创建一个或多个RDD,调用操作来转换RDD,然后调用动作处理被转换后的RDD。
这些步骤大体如下:
(1)定义一个或多个RDD,可以通过获取存储在磁盘上的数据(HDFS,Cassandra,HBase,Local Disk),并行化内存中的某些集合,转换(transform)一个已存在的RDD,或者,缓存或保存。
(2)通过传递一个闭包(函数)给RDD上的每个元素来调用RDD上的操作。Spark提供了除了Map和Reduce的80多种高级操作。
(3)使用结果RDD的动作(action)(如count、collect、save等)。动作将会启动集群上的计算。
当Spark在一个worker上运行闭包时,闭包中用到的所有变量都会被拷贝到节点上,但是由闭包的局部作用域来维护。Spark提供了两种类型的共享变量,这些变量可以按照限定的方式被所有worker访问。广播变量会被分发给所有worker,但是是只读的。累加器这种变量,worker可以使用关联操作来“加”,通常用作计数器。
Spark应用本质上通过转换和动作来控制RDD。后续文章将会深入讨论,但是理解了这个就足以执行下面的例子了。
6、Spark的执行
简略描述下Spark的执行。本质上,Spark应用作为独立的进程运行,由驱动程序中的SparkContext协调。这个context将会连接到一些集群管理者(如YARN),这些管理者分配系统资源。集群上的每个worker由执行者(executor)管理,执行者反过来由SparkContext管理。执行者管理计算、存储,还有每台机器上的缓存。
重点要记住的是应用代码由驱动程序发送给执行者,执行者指定context和要运行的任务。执行者与驱动程序通信进行数据分享或者交互。驱动程序是Spark作业的主要参与者,因此需要与集群处于相同的网络。这与Hadoop代码不同,Hadoop中你可以在任意位置提交作业给JobTracker,JobTracker处理集群上的执行。
7、与Spark交互
使用Spark最简单的方式就是使用交互式命令行提示符。打开PySpark终端,在命令行中打出pyspark。
PySpark将会自动使用本地Spark配置创建一个SparkContext。你可以通过sc变量来访问它。我们来创建第一个RDD。
>>> text = sc.textFile("shakespeare.txt") >>> print text shakespeare.txt MappedRDD[1] at textFile at NativeMethodAccessorImpl.java:-2
textFile方法将莎士比亚全部作品加载到一个RDD命名文本。如果查看了RDD,你就可以看出它是个MappedRDD,文件路径是相对于当前工作目录的一个相对路径(记得传递磁盘上正确的shakespear.txt文件路径)。我们转换下这个RDD,来进行分布式计算的“hello world”:“字数统计”。
>>> from operator import add >>> def tokenize(text): ... return text.split() ... >>> words = text.flatMap(tokenize) >>> print words PythonRDD[2] at RDD at PythonRDD.scala:43
我们首先导入了add操作符,它是个命名函数,可以作为加法的闭包来使用。我们稍后再使用这个函数。首先我们要做的是把文本拆分为单词。我们创建了一个tokenize函数,参数是文本片段,返回根据空格拆分的单词列表。然后我们通过给flatMap操作符传递tokenize闭包对textRDD进行变换创建了一个wordsRDD。你会发现,words是个PythonRDD,但是执行本应该立即进行。显然,我们还没有把整个莎士比亚数据集拆分为单词列表。
如果你曾使用MapReduce做过Hadoop版的“字数统计”,你应该知道下一步是将每个单词映射到一个键值对,其中键是单词,值是1,然后使用reducer计算每个键的1总数。
首先,我们map一下。
>>> wc = words.map(lambda x: (x,1)) >>> print wc.toDebugString() (2) PythonRDD[3] at RDD at PythonRDD.scala:43 | shakespeare.txt MappedRDD[1] at textFile at NativeMethodAccessorImpl.java:-2 | shakespeare.txt HadoopRDD[0] at textFile at NativeMethodAccessorImpl.java:-2
我使用了一个匿名函数(用了Python中的lambda关键字)而不是命名函数。这行代码将会把lambda映射到每个单词。因此,每个x都是一个单词,每个单词都会被匿名闭包转换为元组(word, 1)。为了查看转换关系,我们使用toDebugString方法来查看PipelinedRDD是怎么被转换的。可以使用reduceByKey动作进行字数统计,然后把统计结果写到磁盘。
>>> counts = wc.reduceByKey(add) >>> counts.saveAsTextFile("wc")
一旦我们最终调用了saveAsTextFile动作,这个分布式作业就开始执行了,在作业“跨集群地”(或者你本机的很多进程)运行时,你应该可以看到很多INFO语句。如果退出解释器,你可以看到当前工作目录下有个“wc”目录。
$ ls wc /_SUCCESS part-00000 part-00001
每个part文件都代表你本机上的进程计算得到的被保持到磁盘上的最终RDD。如果对一个part文件进行head命令,你应该能看到字数统计元组。
$ head wc/part-00000 (u'fawn', 14) (u'Fame.', 1) (u'Fame,', 2) (u'kinghenryviii@7731', 1) (u'othello@36737', 1) (u'loveslabourslost@51678', 1) (u'1kinghenryiv@54228', 1) (u'troilusandcressida@83747', 1) (u'fleeces', 1) (u'midsummersnightsdream@71681', 1)
注意这些键没有像Hadoop一样被排序(因为Hadoop中Map和Reduce任务中有个必要的打乱和排序阶段)。但是,能保证每个单词在所有文件中只出现一次,因为你使用了reduceByKey操作符。你还可以使用sort操作符确保在写入到磁盘之前所有的键都被排过序。
一个完整的例子:
from pyspark import SparkContext sc = SparkContext("spark://110.9.17.187:8070", "NetworkWordCount") lines = sc.textFile("hdfs://110.9.17.187:8020/tmp/num.txt") lineLengths = lines.map(lambda s: len(s)) totalLength = lineLengths.reduce(lambda a, b: a + b) print totalLength # # lines.count()
scala 版本如下:
val lines = sc.textFile("hdfs://110.9.17.187:8020/tmp/num.txt") val lineLengths = lines.map(s => s.length) val totalLength = lineLengths.reduce((a, b) => a + b)
PS:我这边用上面的两段代码测试发现(一亿五千万随机数,500MB),scala 比 python 快了 20 倍,跟官方的性能数据相差太远了,
应该是pythonAPI或者环境哪里有问题~
8、编写一个Spark应用
编写Spark应用与通过交互式控制台使用Spark类似。API是相同的。首先,你需要访问<SparkContext,它已经由<pyspark自动加载好了。
使用Spark编写Spark应用的一个基本模板如下:
## Spark Application - execute with spark-submit: spark-submit app.py ## Imports from pyspark import SparkConf, SparkContext ## Module Constants APP_NAME = "My Spark Application" ## Closure Functions ## Main functionality def main(sc): pass if __name__ == "__main__": # Configure Spark conf = SparkConf().setAppName(APP_NAME) conf = conf.setMaster("local[*]") sc = SparkContext(conf=conf) # Execute Main functionality main(sc)
这个模板列出了一个Spark应用所需的东西:导入Python库,模块常量,用于调试和Spark UI的可识别的应用名称,还有作为驱动程序运行的一些主要分析方法学。在ifmain中,我们创建了SparkContext,使用了配置好的context执行main。我们可以简单地导入驱动代码到pyspark而不用执行。注意这里Spark配置通过setMaster方法被硬编码到SparkConf,一般你应该允许这个值通过命令行来设置,所以你能看到这行做了占位符注释。
使用<sc.stop()或<sys.exit(0)来关闭或退出程序。
## Spark Application - execute with spark-submit ## Imports import csv import matplotlib.pyplot as plt from StringIO import StringIO from datetime import datetime from collections import namedtuple from operator import add, itemgetter from pyspark import SparkConf, SparkContext ## Module Constants APP_NAME = "Flight Delay Analysis" DATE_FMT = "%Y-%m-%d" TIME_FMT = "%H%M" fields = ('date', 'airline', 'flightnum', 'origin', 'dest', 'dep', 'dep_delay', 'arv', 'arv_delay', 'airtime', 'distance') Flight = namedtuple('Flight', fields) ## Closure Functions def parse(row): """ Parses a row and returns a named tuple. """ row[0] = datetime.strptime(row[0], DATE_FMT).date() row[5] = datetime.strptime(row[5], TIME_FMT).time() row[6] = float(row[6]) row[7] = datetime.strptime(row[7], TIME_FMT).time() row[8] = float(row[8]) row[9] = float(row[9]) row[10] = float(row[10]) return Flight(*row[:11]) def split(line): """ Operator function for splitting a line with csv module """ reader = csv.reader(StringIO(line)) return reader.next() def plot(delays): """ Show a bar chart of the total delay per airline """ airlines = [d[0] for d in delays] minutes = [d[1] for d in delays] index = list(xrange(len(airlines))) fig, axe = plt.subplots() bars = axe.barh(index, minutes) # Add the total minutes to the right for idx, air, min in zip(index, airlines, minutes): if min > 0: bars[idx].set_color('#d9230f') axe.annotate(" %0.0f min" % min, xy=(min+1, idx+0.5), va='center') else: bars[idx].set_color('#469408') axe.annotate(" %0.0f min" % min, xy=(10, idx+0.5), va='center') # Set the ticks ticks = plt.yticks([idx+ 0.5 for idx in index], airlines) xt = plt.xticks()[0] plt.xticks(xt, [' '] * len(xt)) # minimize chart junk plt.grid(axis = 'x', color ='white', linestyle='-') plt.title('Total Minutes Delayed per Airline') plt.show() ## Main functionality def main(sc): # Load the airlines lookup dictionary airlines = dict(sc.textFile("ontime/airlines.csv").map(split).collect()) # Broadcast the lookup dictionary to the cluster airline_lookup = sc.broadcast(airlines) # Read the CSV Data into an RDD flights = sc.textFile("ontime/flights.csv").map(split).map(parse) # Map the total delay to the airline (joined using the broadcast value) delays = flights.map(lambda f: (airline_lookup.value[f.airline], add(f.dep_delay, f.arv_delay))) # Reduce the total delay for the month to the airline delays = delays.reduceByKey(add).collect() delays = sorted(delays, key=itemgetter(1)) # Provide output from the driver for d in delays: print "%0.0f minutes delayed\t%s" % (d[1], d[0]) # Show a bar chart of the delays plot(delays) if __name__ == "__main__": # Configure Spark conf = SparkConf().setMaster("local[*]") conf = conf.setAppName(APP_NAME) sc = SparkContext(conf=conf) # Execute Main functionality main(sc)
使用<spark-submit命令来运行这段代码(假设你已有ontime目录,目录中有两个CSV文件):
~$ spark-submit app.py
这个Spark作业使用本机作为master,并搜索app.py同目录下的ontime目录下的2个CSV文件。最终结果显示,4月的总延误时间(单位分钟),既有早点的(如果你从美国大陆飞往夏威夷或者阿拉斯加),但对大部分大型航空公司都是延误的。注意,我们在app.py中使用matplotlib直接将结果可视化出来了:
这段代码做了什么呢?我们特别注意下与Spark最直接相关的main函数。首先,我们加载CSV文件到RDD,然后把split函数映射给它。split函数使用csv模块解析文本的每一行,并返回代表每行的元组。最后,我们将collect动作传给RDD,这个动作把数据以Python列表的形式从RDD传回驱动程序。本例中,airlines.csv是个小型的跳转表(jump table),可以将航空公司代码与全名对应起来。我们将转移表存储为Python字典,然后使用sc.broadcast广播给集群上的每个节点。
接着,main函数加载了数据量更大的flights.csv([译者注]作者笔误写成fights.csv,此处更正)。拆分CSV行完成之后,我们将parse函数映射给CSV行,此函数会把日期和时间转成Python的日期和时间,并对浮点数进行合适的类型转换。每行作为一个NamedTuple保存,名为Flight,以便高效简便地使用。
有了Flight对象的RDD,我们映射一个匿名函数,这个函数将RDD转换为一些列的键值对,其中键是航空公司的名字,值是到达和出发的延误时间总和。使用reduceByKey动作和add操作符可以得到每个航空公司的延误时间总和,然后RDD被传递给驱动程序(数据中航空公司的数目相对较少)。最终延误时间按照升序排列,输出打印到了控制台,并且使用matplotlib进行了可视化。
这个例子稍长,但是希望能演示出集群和驱动程序之间的相互作用(发送数据进行分析,结果取回给驱动程序),以及Python代码在Spark应用中的角色。
9、实时处理:Spark Streaming
Spark Streaming 主要用来做实时处理,其原理本质上是“更细粒度的批处理”:
from pyspark import SparkContext from pyspark.streaming import StreamingContext # Create a local StreamingContext with two working thread and batch interval of 1 second sc = SparkContext("spark://110.9.17.187:8070", "NetworkWordCount") ssc = StreamingContext(sc, 3) # Create a DStream that will connect to hostname:port, like localhost:9999 lines = ssc.socketTextStream("110.9.17.187", 9999) # Split each line into words words = lines.flatMap(lambda line: line.split(" ")) # Count each word in each batch pairs = words.map(lambda word: (word, 1)) wordCounts = pairs.reduceByKey(lambda x, y: x + y) # Print the first ten elements of each RDD generated in this DStream to the console wordCounts.pprint() ssc.start() # Start the computation ssc.awaitTermination() # Wait for the computation to terminate
Scala 版本:
import org.apache.spark._ import org.apache.spark.streaming._ // not necessary in Spark 1.3+ // Create a local StreamingContext with two working thread and batch interval of 1 second. // The master requires 2 cores to prevent from a starvation scenario. object Streaming { def main(args: Array[String]) { val conf = new SparkConf().setMaster("local[2]").setAppName("NetworkWordCount") val ssc = new StreamingContext(conf, Seconds(3)) // Create a DStream that will connect to hostname:port, like localhost:9999 val lines = ssc.socketTextStream("localhost", 9999) // Split each line into words val words = lines.flatMap(_.split(" ")) // Count each word in each batch val pairs = words.map(word => (word, 1)) val wordCounts = pairs.reduceByKey(_ + _) // Print the first ten elements of each RDD generated in this DStream to the console wordCounts.print() ssc.start() // Start the computation ssc.awaitTermination() // Wait for the computation to terminate } }
测试:
# TERMINAL 1: # Running Netcat $ nc -lk 9999 hello world ...
# TERMINAL 2: RUNNING NetworkWordCount spark-submit TestScala.jar localhost 9999 ... ------------------------------------------- Time: 1357008430000 ms ------------------------------------------- (hello,1) (world,1) ...
10、结论
尽管算不上一个完整的Spark入门,我们希望你能更好地了解Spark是什么,如何使用进行快速、内存分布式计算。至少,你应该能将Spark运行起来,并开始在本机或Amazon EC2上探索数据。
Spark不能解决分布式存储问题(通常Spark从HDFS中获取数据),但是它为分布式计算提供了丰富的函数式编程API。这个框架建立在伸缩分布式数据集(RDD)之上。RDD是种编程抽象,代表被分区的对象集合,允许进行分布式操作。RDD有容错能力(可伸缩的部分),更重要的时,可以存储到节点上的worker内存里进行立即重用。内存存储提供了快速和简单表示的迭代算法,以及实时交互分析。
由于Spark库提供了Python、Scale、Java编写的API,以及内建的机器学习、流数据、图算法、类SQL查询等模块;Spark迅速成为当今最重要的分布式计算框架之一。与YARN结合,Spark提供了增量,而不是替代已存在的Hadoop集群,它将成为未来大数据重要的一部分,为数据科学探索铺设了一条康庄大道。
11、Refer:
[1] Spark入门(Python版)
http://blog.jobbole.com/86232/
[2] Spark编程指南笔记
http://blog.javachen.com/2015/02/03/spark-programming-guide/#
[3] Spark Streaming Programming Guide
https://spark.apache.org/docs/latest/streaming-programming-guide.html
[4] 大数据算命系列(8): spark框架与pyspark简介
https://github.com/renewjoy/bigdata-fortune-telling/blob/master/08_pyspark/pyspark.rst
[5] PySpark内部实现
http://blog.csdn.net/lantian0802/article/details/36376873
[6] Spark Streaming
http://debugo.com/spark-streaming/
[7] Spark新年福音:一个用于大规模数据科学的API——DataFrame
http://www.csdn.net/article/2015-02-17/2823997
[8] Python vs. Scala vs. Spark
http://emptypipes.org/2015/01/17/python-vs-scala-vs-spark/
[9] Spark1.0.0 应用程序部署工具spark-submit
http://blog.csdn.net/book_mmicky/article/details/25714545
【Spark1.3官方翻译】 Spark Submit提交应用程序,spark1.3spark
http://www.bkjia.com/yjs/980456.html
[10] 使用IntelliJ IDEA开发Spark1.0.0应用程序
http://blog.csdn.net/book_mmicky/article/details/25714549
Scala从零开始:使用Intellij IDEA写hello world
http://blog.csdn.net/asongoficeandfire/article/details/26412493
Scala从零开始:使用Scala IDE写hello world
http://blog.csdn.net/asongoficeandfire/article/details/21490101
运行第一个SparkStreaming程序(及过程中问题解决)
http://www.jianshu.com/p/59733597d448#
来自:http://my.oschina.net/leejun2005/blog/411605